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L’un des objectifs phares de l’UMR AGAP (Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes Méditerranéennes et Tropicales) du CIRAD est la conception et la création d’idéotypes variétaux améliorant la production et la résilience des systèmes de cultures, notamment dans une démarche agro-écologique. La complexité de ces systèmes, les changements et fluctuations grandissantes du climat, impliquent de créer des idéotypes multiples (adaptés à chacun des agro-environnements cibles) et multicritères (répondant à la fois aux contraintes agro-écologiques et aux attentes sociétales locales). Au sein d’AGAP, l’équipe PAM (Plasticité et Adaptation des Monocotylédones) développe des connaissances, des outils de phénotypage et des modèles écophysiologiques permettant d’appuyer l’analyse et la compréhension de la variabilité des phénotypes, l’exploration d’idéotypes variétaux ou de combinaisons optimales génotype X pratiques culturales dans un environnement donné. Au sein de l’équipe PAM, vous analyserez et évaluerez le potentiel agro-écologique et adaptatif de caractères phénotypiques au sein de la diversité génétique du riz ; par la mise en œuvre de phénotypage (milieu contrôlé, champ) sur du matériel génétique choisi avec vos collègues généticiens (UMR AGAP, partenaires), vous contribuerez à l’analyse génétique de ces caractères d’intérêts. Pour cela vous analyserez, avec la biostatisticienne de l’équipe, les interactions GxE en jeu. Votre travail s’appliquera notamment aux enjeux d’efficience d’utilisation des ressources (eau, lumière, azote). Fort(e) de ces connaissances, vous proposerez des améliorations (modules, concepts) à apporter aux modèles de croissance du riz développés par l’équipe PAM (Ecomeristem, SAMARA), ceci en travaillant avec l’informaticien de l’équipe. Vous orchestrerez alors l’application de ce(s) modèle(s) pour évaluer des phénotypes et explorer des idéotypes variétaux. Vous encadrerez des étudiants, thèses et post-docs afin d’appuyer vos travaux. Vous intégrerez les réseaux partenariaux internationaux de l’équipe et d’AGAP sur le riz et serez moteur dans ce contexte pour construire et coordonner des projets. Vous valoriserez vos travaux par la participation à des congrès et la publication.

* Doctorat en biologie végétale (agronomie, biologie intégrative, physiologie…) * Expérience dans la mise en œuvre d’expérimentations végétales (phénotypage) * Expérience en modélisation des plantes : application, amélioration (modules, algorithmes) * Niveau basique en programmation sous un langage de type R/matlab * Niveau basique en statistiques pour l’analyse de données issues du phénotypage * Capacité de travail dans un contexte interdisciplinaire * Bonne pratique de l’anglais lu, écrit et parlé * Capacité démontrée de publication * Capacité et gout pour le partenariat, le montage et la coordination de projets * Des bases en génétique et en analyse génétique (QTL, étude d’association) sont un plus Contraintes du poste * Travail expérimental en serre et au champ en milieu tropical humide * Travail sur écran